【摘要】 目前许多肌腱转录组学研究的最终目的是在体外、离体或体内进行表征。

肌腱转录组学是肌肉骨骼生物学中一个快速发展的领域。目前许多肌腱转录组学研究的最终目的是在体外、离体或体内进行表征。健康和患病的肌腱微环境,以确定驱动人类肌腱病理学的潜在途径。肌腱细胞生态位的基因组、蛋白质组学和代谢组学特征与该生态位对刺激的反应之间的转录组接口。一些最大的瓶颈与人体肌腱组织的可用性和质量有关,因此即使人体组织与平移最相关,也经常使用动物组织。在这里,我们回顾了与人类供体和采购因素相关的变异性,例如肌腱是尸体还是临床残余,以及这些变量如何影响获得的转录组的质量和相关性。此外,年龄、性别和健康人口统计变量会影响人类肌腱转录组。肌腱对细胞提出了组织特异性挑战,细胞核和 RNA 提取包括致密的细胞外基质、低细胞性,因此 RNA 产量低且质量参差不齐。由于需要无偏且有代表性的细胞或细胞核群,考虑这些因素对于单细胞和单核分辨率转录组学尤为重要。肌腱研究界使用不同的细胞、细胞核和 RNA 提取方法、文库制备和质量控制方法,在设计和报告研究时应注意这些。我们讨论了人类肌腱转录组学的不同组成部分和挑战,并为该领域的未来工作提出了管道、质量控制和报告指南。由于需要无偏且有代表性的细胞或细胞核群,考虑这些因素对于单细胞和单核分辨率转录组学尤为重要。肌腱研究界使用不同的细胞、细胞核和 RNA 提取方法、文库制备和质量控制方法,在设计和报告研究时应注意这些。我们讨论了人类肌腱转录组学的不同组成部分和挑战,并为该领域的未来工作提出了管道、质量控制和报告指南。由于需要无偏且有代表性的细胞或细胞核群,考虑这些因素对于单细胞和单核分辨率转录组学尤为重要。肌腱研究界使用不同的细胞、细胞核和 RNA 提取方法、文库制备和质量控制方法,在设计和报告研究时应注意这些。我们讨论了人类肌腱转录组学的不同组成部分和挑战,并为该领域的未来工作提出了管道、质量控制和报告指南。肌腱研究界使用图书馆准备和质量控制方法,在设计和报告研究时应注意这些方法。我们讨论了人类肌腱转录组学的不同组成部分和挑战,并为该领域的未来工作提出了管道、质量控制和报告指南。肌腱研究界使用图书馆准备和质量控制方法,在设计和报告研究时应注意这些方法。我们讨论了人类肌腱转录组学的不同组成部分和挑战,并为该领域的未来工作提出了管道、质量控制和报告指南。

 

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