影响种群间遗传差异的力量之间复杂的相互作用使发现局部适应的遗传基础变得复杂。在这里，我们首次利用逆向生态学和种群转录组学方法来评估热选择对种群分化的贡献，从而考虑了基因表达谱和DNA序列在转录组范围内的变异。我们比较了四只水蚤的转录组大量文献和寻找可能在节肢动物中处于热选择下的候选基因的基础上，研究群体和已鉴定的转录本可能对局部热选择产生响应。转录本中与温度相关的候选基因的过量表达对两个种群之间的序列差异有重大贡献，这表明局部热选择在编码序列水平上起作用。我们发现了大量的转录本，这些转录本可能基于异常值测试和独特的表达特征而有助于局部热适应。然而，在这些基因中，与温度相关的候选基因与整体基因组相比并没有被过度代表，这表明热选择在水蚤之间的差异中起着较小的作用。人口。有趣的是，尽管大多数对序列差异起重要作用的基因在表达水平上对差异没有显着贡献，反之亦然，但受影响的基因功能在两个数据集之间基本保持一致。这表明遗传和调控变异构成了对自然选择反应的替代途径。我们结合使用人口转录组学方法和基于文献的生态学信息候选基因的鉴定，代表了一种有用而强大的方法，在进化生物学中具有广泛的应用。

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