【摘要】 ChIP-Seq技术是将染色质免疫共沉淀技术（chromatin immune precipitation,ChIP)与新一代测序相结合的技术，用于分析全基因组范围内DNA与蛋白质的相互作用。

ChIP-Seq技术是将染色质免疫共沉淀技术（chromatin immune precipitation,ChIP)与新一代测序相结合的技术，用于分析全基因组范围内DNA与蛋白质的相互作用。它的原理是通过首先将蛋白交联到染色质上，然后破碎DNA，用特异的抗体沉淀目的蛋白及相关DNA，纯化与文库构建，最后对富集得到的DNA片段进行高通量测序，通过数据分析，得出在基因组的哪些区域与目的蛋白有相互作用。

 

2006年，Johnson等人发表了首例ChIP-Seq文章，使用罗氏454测序平台测序分析了线虫核小体定位图谱，该研究论证了通过ChIP-Seq技术可获得核小体在全基因组范围内的精确定位。科学家们还对酵母、果羌、小鼠、人类等核小体定位做了大量研究，绘制了不同物种的核小体定位图谱。

 

2007年，Johnson和Robertson等人利用Illumina测序平台在全基因组范围内分析转录因子NRSF/REST和STAT1的结合情况，Johnson等比较了NRSF/REST富集前后2份DNA样本，获得了1946个NRSF/REST结合区。Robertson等分析了宫颈癌HelaS3细胞干扰素诱导前后STAT1的结合位点变化，发现诱导后位点增加了30578个，这是最早的ChIP-Seq技术在转录因子研究中的应用，证明了ChIP-Seq技术在此领域研究中的可行性、特异性和敏感性。此后，科学家们对胚胎干细胞、T细胞、卵巢癌细胞、肝癌细胞、肝脏组织等转录因子的结合位点进行了广泛的研究，ChIP-Seq技术在调控网络研究中发挥了越来越重要的作用。

 

与ChIP-PCR、ChIP-chip相比，ChIP-Seq技术具有高分辨率、高覆盖、低噪音、不受探针序列限制等特点，可以应用到任何基因组序列已知的物种，并能确切得到每一个片段的序列信息，已经成为该领域的主流研究技术。

 

科学指南针是互联网+科技服务平台,500多家检测机构,提供近5万种设备和服务项目,涵盖生物医药、智能硬件、化学化工等多个领域,由专业人员1对1跟踪服务,保证检测质量与效率。