【摘要】 MicroRNAs（miRNAs）是一类长度为19~24个核苷酸，进化上高度保守的非编码小分子单链RNA。

MicroRNAs（miRNAs）是一类长度为19~24个核苷酸，进化上高度保守的非编码小分子单链RNA。miRNAs参与很多重要的生理过程，如生物个体发育、器官形成、凋亡、细胞增殖、肿瘤发生等。新一代测序技术主要应用于新miRNAs预测、miRNAs保守性研究以及miRNAs表达差异分析等科学领域，能解决芯片技术在检测小分子时遇到的序列短、同源度高、灵敏度低等技术难题。

 

Li等人使用I11umina测序分析了正常条件下和氧化胁迫条件下水稻幼苗的miRNAs组，发现了32个新的miRNAs，并首次推断miR3981为植物外显子miRNAs。通过miRNAomes和Northernblot的分析比较，确定在氧化胁迫条件下有7个miRNAs家族呈现显著的差异表达。这些过氧化氢响应的miRNAs的靶基因参与了不同的细胞反应和代谢过程，包括转录调控、养分运输、植物生长素的动态平衡、细胞增殖和细胞程序化死亡等。Jeong等R用水稻幼苗、根、芽和穗组织，在不同环境和营养胁追条件下构建了62个小RNA测序文库，通过测序，绘制了不同组织、不同胁迫条件下miRNAs表达谱;筛选出76个新的miRNAs，其中穗部特异表达的为18个miRNAs，结果表明花较苗、根、芽可能存在更复杂的miRNAs调控基因表达；并发现不同组织中同一家族miRNAs，不同成员表达存在差异；选取部分差异的miRNAs及其靶基因验证，进一步说明不同表达丰度的miRNAs异构体可能动态调节水稻发育过程。

 

新一代测序技术也可用于预测和鉴定miRNAs作用靶基因，检测方法主要包括CLIP-Seq和降解组测序，以及miRNA5p和3p臂选择、miRNA异构体(isomiR）和miRNA编辑等方面研究。

 

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