【摘要】 适用的核糖核酸(RNA)标记方法与先进的荧光成像技术(例如,超分辨率成像)相结合,能够以高时间和空间分辨率对细胞中的RNA进行动态成像,从而深入了解RNA的复杂生物过程。
适用的核糖核酸(RNA)标记方法与先进的荧光成像技术(例如,超分辨率成像)相结合,能够以高时间和空间分辨率对细胞中的RNA进行动态成像,从而深入了解RNA的复杂生物过程。荧光探针的性能和标记特性是实现最终高质量图像的重要因素,尤其是超分辨率RNA成像技术。
荧光原位杂交和分子信标是最早的RNA标记方法,但它们的应用一直受到荧光团-核酸复合物的非渗透性、不稳定性和细胞分布不均匀的限制。随后,RNA结合蛋白(RBP)和适体之间的相互作用被用于标记目标RNA。通常,数十个重复的RBP结合适体被掺入目标信使RNA(mRNA)中,然后荧光蛋白融合RBP(FPs-RBP)在同一个细胞中进行基因编码,允许追踪 mRNA,这种方法被认为是收集基因表达和 RNA 运输数据的黄金参考。然而,高背景荧光和数十个庞大的蛋白质标签可能会影响RNA的运动和功能,并且荧光蛋白容易光漂白从而限制了mRNA的长期超分辨率成像。
最近,荧光染料/适体对被认为是一种有前途的RNA成像工具,其中大型FPs-RBP复合物被具有细胞渗透性和光谱灵活性的染料所取代。这些具有高特异性和亲和力的小分子探针在溶液中是不发荧光的,但当染料特异性识别目标 RNA 适配体时会开启荧光,目前随着指数富集(SELEX)技术的配体系统不断进化,已经在体外鉴定出多种荧光染料-适体对。通常使用三种策略用来点亮染料的荧光,最常用的是限制荧光团的振动和旋转运动,如孔雀石绿(MG)等,作为通常由RNA打开的第一个染料,MG 由于容易振动去激发而具有极低的量子产率,但RNA适体可以通过限制这种振动来增强荧光。目前,已成功实现基于超分辨率RNA成像技术的染料适体发光动态追踪。
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