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2026-07-20
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【摘要】 DFT论文投稿前需要核对软件及版本、泛函与基组、计算方法、收敛标准、几何坐标和虚频信息，并正确引用软件及方法文献。本文整理计算化学论文提高可重复性、可验证性与可追溯性的投稿前自查要点。
你熬了三周跑完 DFT，结果漂亮，能量垒完美吻合实验值。信心满满投出去，两周后收到审稿意见：
"The computational details are insufficient to reproduce the results. The basis set is not specified, and no Cartesian coordinates are provided."
大修。而提前花十分钟就能避免。
问题不是计算水平，是计算合规性没做到位。
1.审稿人打开你的论文，最先翻的 5 样东西
①软件引用：名称、来源、版本号缺一不可，还得引用它背后的方法文献。只写"using Gaussian"不合格。
② 基组与泛函：选了什么不重要，为什么选才重要。JACS 原话："The choice of functional must be justified."
③ 收敛标准：几何优化收敛了吗？阈值是多少？写出来。
④坐标文件：Inorganic Chemistry、Org. Lett.、JOC、Organometallics 四本期刊强制要求提交 .xyz 坐标文件，不是可选项。
⑤ 能量与虚频：绝对能量放 SI 别写正文；虚频数目必须报告，确认是稳定结构还是过渡态。
⚠️ 还有一条"一票否决"
JACS、ACS Central Science、ACS Catalysis 等期刊的作者指南中有一句 硬性否决条款：
"Results obtained from methods or parameters that are not adequately described in the manuscript or in the literature are not acceptable for publication."
简单来说就是：方法或参数描述不清 → 直接不拒
2.投稿前自查清单（6大硬性规定）
不管你投哪本 ACS 期刊，以下清单覆盖了所有类型的核心要求。
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? 论文或 SI 中明确给出力场参数、方法、基组（不能只写方法名）
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? 提供定义模型的方程或其公开文献出处
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? 正确引用所用软件——名称、来源、版本号缺一不可
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? 引用软件所基于方法的原始文献（不只是软件手册）
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? 含电子结构计算时：提供几何坐标（.xyz 或 Z-matrix）
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? 报告虚频数目以确认稳定结构 / 过渡态
? 一个实用建议：在论文写作之初就建一个 computational_details.docx 文件，把每一步计算的方法、基组、泛函、关键词、收敛标准、软件版本都记录下来。写作时直接复制到 Methods 或 SI。这个习惯能帮你省掉返修时翻箱倒柜找参数的时间。
写在最后
计算化学不是"跑完软件出张图就完事"。审稿人要的是三个词：可重现、可验证、可追溯。
参数写清楚、坐标存好、软件引对——这不是应付期刊，是在守护你自己研究的可信度。如果连审稿人都复现不了你的计算，三年后你自己还能复现吗？
计算合规，是学术成果的底线，也是护城河！
