【摘要】 单晶XRD数据分析作图软件Diamond安装与使用

单晶XRD数据分析作图软件Diamond安装与使用

1.Diamond软件下

https://shiyanjia-reports.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/Diamond%203.7z

 

2.Diamond软件安装

打开压缩包,双击打开Diamond 3,双击底下的应用程序,就安装好了。

 

 

3.Diamond软件的一些常规应用

(1)打开我们要作图的cif文件,open a file。

 

 

(2)选中后,一直根据提示点下一步,点完成后,弹出这个窗口,直接点取消就行。

 

 

(3)主界面出来后,先设置键长的范围。

 

 

(4)先点Evaluate,预排除一些不能成键的,然后再进行左边的第二步,对勾的成键范围一一检查下,依据给的键长表或在后缀为cif的文件里查看。右边的滚轮是可以上下移动的,检查都没问题后,点Connect Now,最后点下OK。

 

 

(5)按如下的图标,点一下,可以得到单个分子的结构式。

 

 

(6)结构式出来后,可根据自己的喜欢,对原子,键长,多面体进行设计。

 

 

(7)Atom Designs...   可对原子的颜色,半径,风格进行设计,Style and Colors 是可以修改原子的颜色,风格。Model and Radii 是可以修改原子的类型(如球棍、椭球),半径大小。

 

 

(8)Bond Designs...   主要对原子间键的颜色和粗细进行调整。

 

 

(9)Polyhedron Designs...    主要对多面体进行配色(这种主要用于Mof或无机单晶)。

 

 

(10)调整完后,对原子进行标序号。选中一个原子,右键,Add,点Atom Labels,弹出后,先进行Text,Individual text,输入原子编号,然后再改变字体颜色和大小,最后点OK。

 

 

(11)最后,调整图片的像素和大小,点Layout,然后点Bitmap,可根据杂志的要求,设置像素,长和宽。点Apply Now。图片可能会太大,需要借助放大,缩小工具,如下图3。

 

 

(12)最后导出图片,根据杂志要求,选择需要的格式。

 

 

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