稳定同位素质谱仪在细胞内代谢途径利用中的应用

稳定同位素质谱仪在细胞内代谢途径利用中的应用

细胞内代谢途径的利用可以用稳定同位素标记的营养物示踪来测定。在含有稳定同位素标记的营养物(即示踪剂)的培养基中培养的细胞将其内化和代谢;允许重同位素被纳入代谢途径的反应物、产物和中间体。然后可以用质谱法分析代谢物中存在的重同位素，并通过代谢通量分析(MFA)或人工检查质量同位素分布的定量建模来推断途径利用。

推动在全基因组水平上理解生物学有助于将代谢功能的系统分析(例如稳定同位素示踪测量)与高通量分子测量相结合。将蛋白质组学视为基因功能的传递者：蛋白质组学方法深度的增加和定量分辨率的提高使组织蛋白质组谱与不同的代谢表型相关联，而检测蛋白质磷酸化的灵敏度不断提高，为连接细胞信号级联与影响代谢的应激提供了大量数据。因此，当应用全基因组分子测量的系统分析来推进对基因功能与营养代谢之间相互作用的理解时，基于稳定同位素示踪的测量所产生的标签整合的清晰解释(较少受天然同位素丰度的影响)将是必不可少的。PolyMID-Correct具有单个文本文件输入或完整命令行界面的选项，非常适合作为独立软件补充其他系统测量，或者完全集成到分析多级系统测量的计算管道中。

[1] Jeong H, Yu Y, Johansson H J, et al. Correcting for Naturally Occurring Mass Isotopologue Abundances in Stable-Isotope Tracing Experiments with PolyMID[J]. Metabolites, 2021, 11(5):310.

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