【摘要】 先来介绍一下这个软件。那就要从吸附研究开始讲起了。

同事发来了一条消息:

这周准备发什么干货资料,整理好了没有?

于是我便开始翻箱倒柜,找我的百宝箱。好了,今天就是你了:

RASPA workshop

 

先来介绍一下这个软件。那就要从吸附研究开始讲起了。平时大家都在搞VASP或者CASTEP研究材料和小分子的吸附研究,但是这里只能研究吸附强度(结合能之类的性质),但是对于吸附容量这样的计算要求都是抓瞎状态。于是此时就要祭出GCMC(Grand Canonical Monte Carlo)研究方法了。

 

大家如果对GCMC的概念感兴趣,可以参考SCM的这个页面:

https://www.scm.com/doc/AMS/Tasks/GCMC.html

 

简单来说就是模拟过程中,体系的化学势μ,体积V和温度T保持不变,但是体系的粒子数会发生变化。这个GCMC目前常见的应用就是计算材料的吸附等温线吸附位点等方向。大家接触GCMC最开始可能是从MS的sorption模块开始的。Sorption模块的优势就是使用门槛极低,跟着教程操作一下就能够学会基础使用解决常规的课题了。缺点也很明显,那就是计算的效率比较低,力场编辑麻烦,还有就是贵。

 

如果你经常网上冲浪找寻做吸附研究的这类工具的信息,肯定也听过MuSiC的大名,Randall Snurr开发的高效率开源免费计算工具。但是我向开发者申请软件的时候,对方回复:

 

哥已经带着小伙伴跟David Dubbeldam一起开发RASPA了,建议你也用RASPA吧。

 

我啰嗦了这么久才讲到RASPARASPA是荷兰的阿姆斯特朗大学Dubbeldam课题组领导开发的一款开源免费的GCMC计算工具,在输入文件的撰写和理解上优于其他同类的免费工具,计算速度快拥有预计算格点加速功能黑科技(据说有bug)而且适合高通量计算。基本上你在理解了GCMC的相关概念后,简单学习就能够上手该软件做基础性研究。要说缺点,可视化困难算一个。为了出图,我还要单独学习使用VisIt软件,具体的大家可以参考中科院武汉物理与数学研究所的陈伟博士的相关教程。为了出一张RASPA计算后的吸附质密度图,研究VisIt软件熬了好几晚,真的让人头秃。

 

本次的资源就是Randall Snurr和David Dubbeldam真人出镜的workshop视频资源。这个软件以及方向还比较小众,原地址的播放数也很惨淡。这个是我当时学习的时候下载的,今天回原地址去找,发现已经被下架了,可能这个真的是绝版了。不仅讲解了GCMC的相关概念,还讲解了RASPA的实际使用方法,可谓是从起步到起飞的一条龙服务了。

 

 

 

 

 

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