【摘要】 哪位大佬能够分享一下氧化石墨烯的cif,跪求!!!

哪位大佬能够分享一下氧化石墨烯的cif,跪求!!!

 

如果你常年混迹于各种计算化学的论坛和讨论组,这样的问题你肯定听到过。

 

作为技术老鸟的你,此时肯定感慨万千,并指着这个问题告诉自己的师弟:你看,这就是连氧化石墨烯是什么都没搞懂的人问出的问题。

 

 

先把标题的问题解决一下,再去唠后面的内容。

 

氧化石墨烯(GO)是非晶的,所以不可能在任何数据库中找到氧化石墨烯的cif

 

那么还原氧化石墨烯(rGO)呢?也不可能有。

 

如果你是要在文章中计算使用到GO这样的材料,应该自己构建,盲目抄别人的结构是有大问题的。比如你的做了红外,XPS,Boehm滴定之类的表征,研究了上面的氧的类型和数量,那么在建模的时候做一块大的石墨烯纯净表面去自己修饰,得到你的氧化石墨烯结构。rGO同理。

 

如果你对自动化建模感兴趣,需要自行编写perl脚本,使用MS解决问题,思路是对胞内C进行编号,随机选取C进行官能团添加

 

但其实,这个问题,已经被很多大佬想过了,能够脚本解决的问题,大佬们绝对不会手动去弄。那种用QuantumATK建模的方法,这里就不提了。以下是几个被认可的免费脚本来源:

 

1.Graphene-Oxide-Generator

 

https://github.com/Ngtungfei/Graphene-Oxide-Generator

 

该脚本是Wu Tongfei老师的作品,目前已经停止更新,目前吴老师和合作者在下面地址更新https://github.com/punkpony/Graphene-Oxide-Generator2

 

2.GOMonteCarlo

 

https://github.com/aruth2/GOMonteCarlo

 

3.Graphite, Graphene and Graphene Oxide Builder

 

Graphite, Graphene and Graphene Oxide Builder

 

https://github.com/velocirobbie/make-graphitics

 

4.GOPY: A tool for building 2D graphene-based computational models

 

https://github.com/Iourarum/GOPY

 

虽说GO是结构是不确定的,但总有一些门道或者让大家认可的建模方法,做这个方向的同学请一定认真看一次https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.9b00114

 

GO的问题说到这里。接着再多说几句,很多时候,我们做计算的模型都是要自己去构建的,并不是所有的结构都是能够直接下载到的

 

比如合金,不同的比例,可以构建出不同的结构,同一种比例也会有不同的排列方式,如果真的有人构建了一个万能的数据库,光几个合金的穷举结构都能爆满数据库硬盘。

 

还有一种情况,有很多人在求Ni Fe水滑石的结构文件,其实,只要修改Ni(OH)2的结构,按需替换Ni为Fe,再补全抗衡离子就好了。

 

在进行相关课题研究之前,一定要先进行足够的文献调研,搞清楚自己要研究的体系究竟是怎么一回事再去做计算也不迟。

 

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