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16s/ITS菌株鉴定
98.8%
好评率
仪器型号
ABI 3730XL
预约次数
1678次
服务周期
收到样品后平均3.0-10.0工作日完成
部分论文致谢
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期刊名称
奖励现金
申请时间
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项目简介
采用测序方法对各种细菌16S rDNA或者真菌的 ITS进行了广泛的研究，获得了大量的DNA序列信息，保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系，而高变序列区域则能体现物种间的差异。将测序得到的16S rDNA序列在NCBI上进行Blas比对，即可获知与该序列同源性较高的已知序列，为确定菌种的分类学地位提供依据。
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结果展示
样品要求
送样须知：
- 请务必认真填写各项内容
- 寄送样品时请您附带一份送样单
- 因实验样品不纯造成的测序套峰，我们将收取全额的实验费用
- 不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性
送样要求：
菌株鉴定的送样要求
菌株鉴定的送样要求 可以接受单一菌落/菌液/菌株基因组DNA溶液鉴定，需要客户提供纯化后的菌株。
1 对数生长期菌液要求
1.1OD600=0.6-0.8， ≥2mL，请确保您提供的菌液经过平板或斜面上的单菌落分离。
1.2从单菌落接种的2mL以上肉眼可见混浊的菌液，也可以是从平板收集的菌体，重悬于无菌生理盐水或者PBS缓冲液，但前提均是纯化菌株。
1.3常温运输。
1.4不接受具有致病性的样品。如果菌株带有致病性，请提供菌株的基因组DNA溶液。
2 新鲜平板/斜面/穿刺菌
2.1 新鲜平板须长有分离的单菌落，斜面/穿刺菌请确保送测样品由单菌落培养而来。
2.2 平板/斜面/穿刺菌一定要做好密封（可使用封口膜或保鲜膜充分缠绕密封），密封后必须使用报纸或泡沫包裹，以防运输过程会出现染杂菌、受到振荡/挤压破裂变形等问题。
2.3 常温运输。
2.4 不接受具有致病性的样品。如果菌株带有致病性，请提供菌株的基因组DNA溶液。
3 基因组DNA溶液
3.1 浓度≥50 ng/μL，总体积≥10μL，且纯度达标（OD260/OD280在1.6-1.8之间）。
3.2 干冰运输。
实验流程：
1. 菌种基因组DNA提取
2. rDNA特异引物进行PCR扩增及扩增产物纯化
3. DNA测序及序列比对
服务周期：
常规样品收到样品1-2周左右出报告，具体实验周期及送样时间请与科学指南针工作人员沟通确认，谢谢！
交付内容：
1.测序原始数据
2.比对结果
3.实验报告
4.进化树分析（可选）
