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      16s/ITS菌株鉴定

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      仪器型号 ABI 3730XL
      预约次数 135次
      服务周期 3.0-10.0日完成

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      项目简介

      采用测序方法对各种细菌16S rDNA或者真菌的 ITS进行了广泛的研究,获得了大量的DNA序列信息,保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。将测序得到的16S rDNA序列在NCBI上进行Blas比对,即可获知与该序列同源性较高的已知序列,为确定菌种的分类学地位提供依据。

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      样品要求

      送样须知:

      1. 请务必认真填写各项内容
      2. 寄送样品时请您附带一份送样单
      3. 因实验样品不纯造成的测序套峰,我们将收取全额的实验费用
      4. 不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性

      送样要求:

      菌株鉴定的送样要求
      菌株鉴定的送样要求 可以接受单一菌落/菌液/菌株基因组DNA溶液鉴定,需要客户提供纯化后的菌株。
      1 对数生长期菌液要求
      1.1OD600=0.6-0.8, ≥2mL,请确保您提供的菌液经过平板或斜面上的单菌落分离。
      1.2从单菌落接种的2mL以上肉眼可见混浊的菌液,也可以是从平板收集的菌体,重悬于无菌生理盐水或者PBS缓冲液,但前提均是纯化菌株。
      1.3常温运输。
      1.4不接受具有致病性的样品。如果菌株带有致病性,请提供菌株的基因组DNA溶液。
      2 新鲜平板/斜面/穿刺菌
      2.1 新鲜平板须长有分离的单菌落,斜面/穿刺菌请确保送测样品由单菌落培养而来。
      2.2 平板/斜面/穿刺菌一定要做好密封(可使用封口膜或保鲜膜充分缠绕密封),密封后必须使用报纸或泡沫包裹,以防运输过程会出现染杂菌、受到振荡/挤压破裂变形等问题。
      2.3 常温运输。
      2.4 不接受具有致病性的样品。如果菌株带有致病性,请提供菌株的基因组DNA溶液。
      3 基因组DNA溶液
      3.1 浓度≥50 ng/μL,总体积≥10μL,且纯度达标(OD260/OD280在1.6-1.8之间)。
      3.2 干冰运输。

      实验流程:

      1.  菌种基因组DNA提取

      2.  rDNA特异引物进行PCR扩增及扩增产物纯化

      3.  DNA测序及序列比对

      服务周期:

      常规样品收到样品1-2周左右出报告,具体实验周期及送样时间请与科学指南针工作人员沟通确认,谢谢!

      交付内容:

      1.PCR产物电泳图

      2.测序原始数据

      3.比对结果

      4.实验报告

      5.进化树分析(可选)

       

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