16s/ITS菌株鉴定

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      仪器型号 ABI 3730XL
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      项目简介

      采用测序方法对各种细菌16S rDNA或者真菌的 ITS进行了广泛的研究,获得了大量的DNA序列信息,保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。将测序得到的16S rDNA序列在NCBI上进行Blas比对,即可获知与该序列同源性较高的已知序列,为确定菌种的分类学地位提供依据。

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      样品要求

      送样须知:

      1. 请务必认真填写各项内容
      2. 寄送样品时请您附带一份送样单
      3. 因实验样品不纯造成的测序套峰,我们将收取全额的实验费用
      4. 不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性

      送样方式:

      1.  待测样品

      ①基因组DNA:浓度≥50 ng/μl,总体积≥10μl,且无明显降解;

      ②菌液样本:OD0.6左右,1-2ml菌液,1.5mlEP管封口膜缠好后送样。

      实验流程:

      1.  菌种基因组DNA提取

      2.  rDNA特异引物进行PCR扩增及扩增产物纯化

      3.  DNA测序及序列比对

      服务周期:

      收到样品1-2周左右出报告,具体实验周期及送样时间请与科学指南针工作人员沟通确认,谢谢!

      交付内容:

      1.PCR产物电泳图

      2.测序原始数据

      3.比对结果

      4.实验报告

      5.进化树分析(可选)

       

      常见问题

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