【摘要】 本文的脚本,来自于https://bioviacommunity.force.com/在不登陆账号的情况下,可以自由下载查看的内容

本期推送我在MS官方售后论坛里面淘来的界面张力计算脚本

 

本文的脚本,来自于https://bioviacommunity.force.com/在不登陆账号的情况下,可以自由下载查看的内容

 

计算界面张力的脚本,脚本作者是Jason DeJoannis,就是写了xlink脚本的那位大佬。对xlink交联脚本感兴趣的同学可以点击Forcite交联脚本

 

该脚本需要用户自定义的数据在脚本中有着明显的提示,这里就不多赘述了。针对脚本使用前的体系该如何模拟,Jason在论坛中给出了自己的回答,这里很有必要跟大家说一下。

 

这里可以计算液-液界面和液-真空界面的界面张力,使用的公式在前面的注释部分给出了,如果需要引用文献可以引用J Chem Phys B, 2007, 11, 7812; Molecular Simulation, 2007, 33, 27

 

*如果计算液-真空界面,就像下图一样。一定要使用NVT系综进行计算。为啥不能用NPT?这个大家建议建模如下图然后尝试一样NPT系综模拟,这样你得到的宝贵经验会指导你以后的模拟计算。不想亲自模拟的,可以在本文的角落处找到我给出的问题答案。

 

 

*如果是研究液-液界面,那么需要先进行NPT作为平衡过程然后NVT生产过程收集轨迹文件

 

无论哪种界面,都要注意,要保持层层分明,一不小心搞成乳液了就没办法算了。

 

阅读原文:界面张力计算脚本(配合Forcite使用)